진캐스트는 변이특이적 유전자 증폭 원천기술을 통해 정상유전자는 그대로 두고 암 유전자만 증폭하는 ADPS™를 개발했습니다. qPCR로 최대 0.0001%(3/3,000,000)의 검출민감도로 암유전자를 분석할 수 있습니다.
다만 실제 진단용 제품은 진단품질의 안정성과 임상현장의 현실을 고려하여 검출민감도를 0.01%로 조정하였습니다. ADPS™는 액체 생검과 조직 생검으로 1기 암환자의 암유전자를 정밀하게 분석하기 때문에 가장 정확한 진단과 처방을 내릴 수 있습니다.
ADPS™는 DNA polymerase가 스스로 변이유전자를 인식하는 분별능을 탑재하여 변이특이적 증폭이 가능한 ADPS™ Smart DNAP기술이 핵심이며, 이 새로운 DNA Polymerase의 성능을 극대화하는 primer-probe설계기술과 버퍼 최적화기술을 융합하여 개발되었습니다.
초고민감도로 ctDNA 액체생검에 최적화된 ADPS™는 0.01%의 MAFs(mutants allele fraction)을 갖고 있는 환자의 암 유전자를 분석할 수 있습니다.
초고민감도의 핵심, ADPS™ Smart DNAP에 대한 기술 설명은 “ADPS™는 어떻게 초고민감도를 구현하는가”에서 자세하게 알 수 있습니다.
ADPS™ Smart DNAP는 프라이머 설계(길이와 Tm)에 따라 정상 유전자와 변이 유전자를 구별하는 성능에 차이를 보이기 때문에 진캐스트는 qPCR에 적합한 유전자 변이 특이적인 프라이머 설계 규칙과 프라이머 Tm 계산 방법을 자체적으로 개발했습니다.
ADPS™의 프라이머-프로브는 SNV(single nucleotide variants), insertion, deletion, rearrangement 등 다양한 변이를 효과적으로 검출할 수 있도록 설계되었습니다.
진캐스트가 독자개발한 ADPS™의 반응완충용액은
pH, 1가 또는 2가의 이온 농도, PCR enhancer의 조합을 이용하여 최소검출한계 3copies가 가능하도록 설계되었습니다.
이에 따라 ADPS™의 최소검출한계는 3copeis로 검출민감도 0.01%에 최적화되어 있습니다.
FAM | L858R mutant (copies) |
gDNA (copies) |
---|---|---|
Red | 30,000 | 0 |
Orange | 3,000 | 27,000 |
Yellow | 300 | 29,700 |
Green | 30 | 29,970 |
Blue | 3 | 29,997 |
Black | 0 | 30,000 |
진캐스트가 독자개발한 기술을 융합하여 프라이머-프로브 설계만으로 다양한 암 유전자를 정확하게 검출할 수 있는
액체생검 플랫폼 기술 ADPS™는 10가지 특장점을 자랑합니다.
1.최대 0.0001%, 실제 진단키트 0.01%의 높은 검출민감도로 진단 정확성 제공 2.단일 혈액 샘플로 채취된 ctDNA를 분석하고 진단 3.ctDNA 분리에서 검사까지 2시간 30분의 turnaround time 4.고가의 장비와 reagent 필요하지 않은 경제적인 진단비용 5.조직 검사와 액체 검사의 높은 일치율(concordance) 6.단일염기변이, 삽입/결실, 유전자 융합변이 등 다양한 유전자 변이 해독 가능 7.Heterogeneity에 대한 ctDNA 검사 가능 8.정확한 암 유전자 분석으로 personalize medicine 가능 9.다양한 clinical PCR과 primer extension을 이용한 ctDNA 검사에 적용 가능 10.조직생검과 액체 생검 모두 적용 가능